Nat Biotechnol:研究不能重复?可能是HeLa细胞系“反为”了

2021-11-29 04:31:21 来源:
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HeLa细胞内不太有可能在欧美的许多研究团队人才了近70年,并且长期以来被显然是无限供应的不不定的完全一致细胞内。然而,2月末18日发表在《Nature Biotechnology》月末刊上的一项取而代之研究成果表明,细胞内在有所不同研究团队相互间共存极大关联性,这引发了对细胞内系研究成果重复性的质疑。“我很吃惊看见这项研究成果,但在某种意义上我并不令人难以置信,”斯隆史蒂芬恩癌症之中心的分子人类学家Prasad Jallepalli说,他没有投身于这项研究成果。这并不是HeLa细胞内系自诞生以来第一次显现出现多样化的报导:多年来,其他研究成果该小组也显然了HeLa细胞内不定异基底相互间在转录和RNA强调的显着关联性。这项最取而代之研究成果首次全面分析了各种HeLa不定异基底的基因型(有所不同同型的HeLa细胞内系境遇在欧美的各个研究团队),并且首次显然表现型异质性引发了核糖基底强调和表现型基因的改不定。HeLa细胞内“不定了”?在这项研究成果之中,研究成果部门从6个第三世界的13个研究团队收集了14份HeLa样本,并在完全一致的研究团队前提下进行人才。他们首先量化了基因拷贝数不定异,概述了它们DNA相互间的显着关联性。结果辨认显现出,HeLa不定异基底相互间,特别是CCL2和Kyoto不定异基底相互间共存着前所未见的异质性。更进一步的于数,许多这些表现型关联性裂解为mRNA归因于的改不定,并且在较小程度上裂解为核糖基底丰度的改不定。研究成果部门报告说,HeLa CCL2和Kyoto细胞内系的转录组和核糖基底组谱彼此相互间的关联性,就像来自两种有所不同类型其组织的恶性肿瘤内系相互间的关联性一样。HeLa不定异基底在人才流程之中植被速度也有所不同,一些细胞内群集必需17.5小时才能翻倍,而另一些细胞内在完全一致的人才前提下必需话费将近32小时。它们对大肠杆菌染病的底物也有所有所不同:与其他两种不定基底相比,一种不定基底对染病的持久性较低,研究成果部门将其归因于除此以外的核糖基底复合物,这种核糖基底复合物在细菌转入体内细胞内之中起主导作用。在一项实际上的实验室之中,研究成果该小组通过人才细胞内系三个月末,来观察HeLa不定异基底的介导是否会随着时间改不定。研究成果部门记录了更早细胞内和末期细胞内相互间介导关联性大约6%。卢塞恩合众国理工学院分子系统生物学研究成果所的Ruedi Aebersell教授是该研究成果的合着者,他说,“即使在同一个研究团队那时候,这些细胞内的关联性和改不定速度也是非常前所未有的。”他预估,如果一个研究成果生在单项开始时用HeLa细胞内系做了一个实验室,并在六个月末后被要求重复这个实验室,他们有可能会赢取有所不同的结果。关于研究成果之中的“可复制性危机”的探讨大多数集之中在的系统、数据分析各个方面的缺陷,以及作为主要传动装置因素的受污染或白纸错标签的细胞内系。但是Aebersell显然,HeLa细胞内系和恶性肿瘤内系的生物学关联性有可能是关键。为什么会“不定”?斯坦福大学的细胞内人类学家Tim Stearns显然有几个有可能的原因可以断言为什么细胞内系在间歇人才正向改不定。首先,HeLa细胞内是已知DNA不稳定的恶性肿瘤内,因此很有可能随时间随机突不定。此外,它们还会在研究团队之中受到各种植被前提的严重影响,这有可能会促使细胞内进化显现出独特的特征。例如,他说,动物细胞内的人才包括将其人才到充满着一个人才皿为止,从人才皿之中抽取一部分细胞内,然后将它们摆在另一个人才皿之中植被,这一流程专指内部矛盾。“每个人做这件事情的方法都实在太有所不同,”他想到。最取而代之这些辨认显现出,对于人类人才细胞内的研究成果结果的断言和复原性有一定的意义。Aebersell和他的同事情在学术论文之中提显现出了几个具基底的解决办法。首先,研究成果部门应该使用恶性肿瘤内系的更早传代,并确保在同一细胞内系的有所不同样本之中重复同一细胞内系的实验室。更极其重要的是,人类学家应该清楚地报告他们在给定的研究成果之中使用的细胞内系不定异基底。
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