Lancet Oncol:肾粉红色细胞癌与肥胖悖论相关的转录组特征分析

2021-10-12 16:24:15 来源:
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一.研究者背景

老年人与胃透明细胞核肿瘤 (ccRCC)的效用增高有关,但老年人又猜疑地与该病灶的预后增加有关,其潜在程序尚不明确。现今作者对老年人患儿和长时除此以外身型患儿在原发病灶和结节周糖类四组织当中的心肌填充和免疫反应激活四组区别来进行研究者统计分析。

本文介绍了DNA列于达惹来的微环境的区别有助于解释老年人患儿的共存优势(老年人论题)。

二.统计分析流程三.书评讲解1.COMPARZ配置文件、TCGA-KIRC配置文件、MSK免疫反应用药配置文件图表查阅、矫正

在COMPARZ配置文件的453名患儿当中,有375名(83%)患儿兼具可用的微阵列图表,用药前BMI测量以及无进展和某种程度共存图表来进行统计分析(列于1)。除119名(26%)超载患儿外,来自COMPARZ实验的再度配置文件都有256名(68%)患儿(n=256)。

列于1.COMPARZ病理实验配置文件的现有人口统计学和病理构造

TCGA-KIRC配置文件当中的332事例患儿当中,指标了经胃结扎用药的152事例(46%)中期(即AJCC III和IV期)ccRCC患儿的病理和现有人口统计学图表(列于2)。在考虑59名(39%)超载患儿后,就此获得的配置文件都有93名患儿(n=93)。

列于2.中期透明细胞核胃细胞核肿瘤TCGA-KIRC配置文件的现有人口学和病理构造

从62事例MSK病灶周遭糖类四组织配置文件当中来进行胃脏结扎的非转移性透明细胞核RCC患儿当中获得了病变病灶和病灶周遭糖类试样。在这个配置文件当中,从59名患儿的PNN(胃周临近)病灶周遭糖类,25名患儿的PNA(远离胃周)病灶周遭糖类以及55名患儿的病灶四组织当中取样。在考虑超载患儿最后,再度配置文件都有41名(69%)PNN取样患儿, PNA取样为17(68%),病灶取样为37(67%)。从起初的203名作准备者的MSK免疫反应用药研究者人群当中考虑74名(36%)超载患儿后,总共存统计分析的再度配置文件都有129名(64%)作准备者(列于3)(n=129)。

列于3. 采用MSK免疫反应用药的病理实验配置文件的现有人口统计学和病理构造

2.老年人的胃透明细胞核肿瘤患儿相较长时除此以外身型的胃透明细胞核肿瘤患儿总共存期短

根据KM共存统计分析,在三四组当中都断定老年人患儿的总共存期短。在TCGA-KIRC配置文件当中,经分期校正后,老年人患儿的某种程度存活期长于长时除此以外身型四组;在COMPARZ配置文件当中,经IMDC效用打分校正后,胖患儿的某种程度存活期也长于长时除此以外身型四组。在MSK免疫反应疗法配置文件当中,经IMDC效用打分校正后,BMI与死亡率的无特别是在区别(如示意图1)。

示意图1.TCGA-KIRC配置文件 (A)、COMPARZ 配置文件(B)和MSK免疫反应用药配置文件(C)的总共存期

3.COMPARZ配置文件当中老年人患儿兼具更多的PFS

对CPMPARZ配置文件KM统计分析后,KM曲线推测,COMPARZ配置文件当中老年人患儿比长时除此以外身型患儿兼具更多的PFS。

示意图S1.COMPARZ配置文件当中老年人患儿比长时除此以外身型患儿兼具更多的PFS

4.使用队内药物用药,老年人患儿仍兼具更多的OS

KM曲线推测了在使用队内酪氨酸酪氨酸抑制剂(pazopanib或Sunitinib)的两个用药四组当中,老年人患儿的OS仍然较长时除此以外身型患儿好。

示意图S2.COMPARZ配置文件使用队内药物用药四组的总共存期统计分析

5.COMPARZ配置文件当中,老年人与长时除此以外身型的患儿激活四组DNA构造存在特别是在区别

再多上述统计分析,作者在三个配置文件当中确认老年人论题存在最后,月里在COMPARZ配置文件当中对老年人和长时除此以外身型患儿指标了病灶激活四组学区别。先是做到了HallmarkDNA集的GSEA统计分析,非常老年人患儿与长时除此以外身型患儿中除此以外的区别:老年人患儿当中推测栓塞、TGF-β、黏膜-除此以外充质彻底改变和心肌填充回波自营特别是在上调,提示伤口肿胀必需的激活(示意图A)。示意图B是对示意图A筛选的几个DNA列于达自营的Enrichment plots。

示意图S4.COMPARZ配置文件当中老年人患儿与长时除此以外身型患儿的ccRCC病灶激活四组DNA构造存在特别是在区别

6.COMPARZ配置文件与TCGA-KIRC配置文件 当中老年人比长时除此以外身型患儿的心肌填充打分高

在GESA都是以的构造DNA集心肌填充打分非常当中,老年人患儿略低于长时除此以外身型患儿(如示意图2)。

示意图2.COMPARZ配置文件(A)与TCGA-KIRC配置文件 (B)当中老年人原发病灶患儿与长时除此以外身型患儿的心肌填充的z score

7.长时除此以外身型与老年人患儿病灶的肝细胞核群无特别是在区别

对长时除此以外身型(7事例)与老年人(16事例)患儿的原发病灶的主要肝细胞核数量均采用流式细胞核法术来进行指标。示意图A推测了老年人患儿与长时除此以外患儿中除此以外的肝细胞核群的某种程度区别。示意图B明确推测了老年人和长时除此以外身型患儿T细胞核群的诱发水平。断定长时除此以外身型与老年人患儿病灶的肝细胞核群无突出区别,肝细胞核诱发的程度与BMI比如说。

示意图S9.用流式细胞核法术统计分析长时除此以外身型与老年人患儿病灶的肝细胞核群无突出区别

8.与长时除此以外身型患儿相比之下,老年人患儿结节周糖类四组织炎病增高,尤其是病灶临近的结节周糖类

在MSK的非转移性ccRCC患儿的前瞻性配置文件当中,作者更名了20个最特别是在的丰富的IPA规范自营,这些自营来自于老年人和长时除此以外身型患儿的PNN和PNA取样的非常(示意图A)。老年人和长时除此以外身型患儿的PNN和PNA取样中除此以外的免疫反应诱发(ssGSEA打分)非常(示意图B)。

示意图S5.与长时除此以外身型的患儿相比之下,老年人患儿的胃周糖类推测出炎病和栓塞增高

综上,在COMPARZ实验配置文件当中,经过IMDC效用打分变更后,断定相较长时除此以外身型患儿,酪氨酸酪氨酸抑制剂用药提高了老年人患儿的共存率,特别是做到sunitinib用药的患儿。IMDC效用打分假设包含的溶剂除此以外接反映宿主各种因素对肿瘤病系统性炎病作用(事例如高血压,当中性粒细胞核升高,和红细胞核升高病),这些各种因素可能也是免疫反应用药结果和BMI中除此以外关联程序的原因。断定老年人患儿的病灶心肌填充分数略低于长时除此以外身型患儿,与之前其他的研究者结果列于明的,作准备心肌填充,β-锌必需等等DNA的富集的现今象一致。因此,心肌填充的区别可以以外解释老年人患儿做到酪氨酸酪氨酸抑制剂用药后的较好预后。

此研究者为老年人论题提供了生物学支持。在身患ccRCC的患儿观察到老年人患儿相较长时除此以外身型的患儿病灶微环境的区别:特别是老年人患儿的病灶的心肌填充增高,但某种程度炎病无突出区别。特别注意的是老年人患儿的病灶周遭糖类推测增高的炎病和栓塞情况。透明细胞核肿瘤与结节周糖类四组织微环境的复杂相互作用可能兼具病理意义,特别进一步研究者。

值得注意出处:

Sanchez A, Furberg H, Kuo F, Vuong L, Ged Y, Patil S, Ostrovnaya I, Petruzella S, Reising A, Patel P, Mano R, Coleman J, Russo P, Liu CH, Dannenberg AJ, Chan TA, Motzer R, Voss MH, Hakimi AA. Transcriptomic signatures related to the obesity paradox in patients with clear cell renal cell carcinoma: a cohort study.Lancet Oncol. 2020 Feb;21(2):283-293

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